Второй космический полёт Е. В. Кондаковой — в качестве специалиста на американском корабле «Атлантис» (англ. Space Shuttle Atlantis) в составе экспедиции STS-84 состоялся с 15 по 24 мая 1997 года по программе шестой стыковки с орбитальной станцией «Мир».
Уволилась из отряда космонавтов РКК «Энергия» 30 декабря 1999 года в связи с избранием депутатом Государственной Думы. С 1999 года по 2003 год — депутат Государственной Думы РФ 3-го созыва от партии «Отечество — Вся Россия». С 2003 по 2011 годы — депутат Государственной Думы РФ 4-5 созывов от партии «Единая Россия». В 2006 году окончила Дипломатическую академию МИД России.
16 августа 2011 года Елена Кондакова заявила о выходе из «Единой России» в связи с несогласием с результатами августовских внутрипартийных выборов.
Людям выдавались листы с номерами людей, за которых было необходимо голосовать, при подсчете бюллетеней оказывалось, что их больше, чем людей на площадке.
Праймериз «Единой России» — экономически нецелесообразная игра в демократию.
Я осознаю, что мое заявление означает конец моей политической карьеры…
16 августа 2011 года Елена Кондакова заявила о выходе из «Единой России» в связи с несогласием с результатами августовских внутрипартийных выборов. 27 марта 2012 года назначена торговым представителем РФ в Швейцарии.
Космонавт Елена Кондакова. Видеоэнциклопедия «Космонавты». Телестудия Роскосмоса
Кондакова, Елена Владимировна. Сайт «Герои страны».
Профиль в большой российской энциклопедии