Шахшаев Марат Кадиевич занимается лечением патологий опорно-двигательного аппарата: артрозы суставов, деформации нижних конечностей, внутрисуставные повреждения коленного и плечевого суставов, деформации стопы (Hallux valgus, Hallux Rigidus, Hallux Limitus, молоткообразные деформации пальцев, деформация Тейлора, метатарзалгия, брахиметатарзия, а также неврома Мортона), последствия травм нижних и верхних конечностей.