Американские учёные из Калифорнийского университета в Сан-Франциско разработали новый геномный тест, который может быстро определять типы подавляющего большинства патогенов. Исследование было опубликовано в научном журнале Nature Medicine (NatMed).
Технология основана на методе, называемом метагеномным секвенированием нового поколения (mNGS). Этот метод анализирует все нуклеиновые кислоты — как РНК, так и ДНК — присутствующие в образце.
Первоначально учёные разработали клинический тест mNGS для анализа спинномозговой жидкости (СМЖ), которая омывает головной и спинной мозг. Впоследствии тест был протестирован на тысячах пациентов с необъяснимыми неврологическими симптомами в различных больницах США.
Как сообщают авторы исследования, в ходе анализа 5 тысяч образцов СМЖ, метод mNGS accurately определил патоген в 86% случаев за 30 минут. Для сравнения, прежние методы геномного секвенирования требовали до семи дней для получения результатов.
Дополнительные исследования показали, что новый тест также эффективен в выявлении возбудителей респираторных инфекций, включая SARS-CoV-2, вызывающий COVID-19.
Команда учёных также промоделировала способность технологии обнаруживать дивергентные вирусы (или недавно появившиеся штаммы) и обнаружила, что методика потенциально может находить любые патогены, которые могут возникнуть в будущем.